再见,可视化!你好,Pandas!,


用Python做数据分析离不开pandas,pnadas更多的承载着处理和变换数据的角色,pands中也内置了可视化的操作,但效果很糙。

因此,大家在用Python做数据分析时,正常的做法是用先pandas先进行数据处理,然后再用Matplotlib、Seaborn、Plotly、Bokeh等对dataframe或者series进行可视化操作。

但是说实话,每个可视化包都有自己独特的方法和函数,经常忘,这是让我一直很头疼的地方。

好消息来了!从最新的pandas版本0.25.3开始,不再需要上面的操作了,数据处理和可视化完全可以用pandas一个就全部搞定。

pandas现在可以使用Plotly、Bokeh作为可视化的backend,直接实现交互性操作,无需再单独使用可视化包了。

下面我们一起看看如何使用。

1. 激活backend

在import了pandas之后,直接使用下面这段代码激活backend,比如下面要激活plotly。

  1. pd.options.plotting.backend = 'plotly' 

目前,pandas的backend支持以下几个可视化包。

  •  Plotly
  •  Holoviews
  •  Matplotlib
  •  Pandas_bokeh
  •  Hyplot

2. Plotly backend

Plotly的好处是,它基于Javascript版本的库写出来的,因此生成的Web可视化图表,可以显示为HTML文件或嵌入基于Python的Web应用程序中。

下面看下如何用plotly作为pandas的backend进行可视化。

如果还没安装Plotly,则需要安装它pip intsall plotly。如果是在Jupyterlab中使用Plotly,那还需要执行几个额外的安装步骤来显示可视化效果。

首先,安装IPywidgets。

  1. pip install jupyterlab "ipywidgets>=7.5" 

然后运行此命令以安装Plotly扩展。

  1. jupyter labextension install jupyterlab-plotly@4.8.1 

示例选自openml.org的的数据集,链接如下:

数据链接:https://www.openml.org/d/187

这个数据也是Scikit-learn中的样本数据,所以也可以使用以下代码将其直接导入。

  1. import pandas as pd  
  2. import numpy as np  
  3. from sklearn.datasets import fetch_openml  
  4. pd.options.plotting.backend = 'plotly'  
  5. X,y = fetch_openml("wine", version=1, as_frame=True, return_X_y=True)  
  6. data = pd.concat([X,y], axis=1)  
  7. data.head() 

该数据集是葡萄酒相关的,包含葡萄酒类型的许多功能和相应的标签。数据集的前几行如下所示。

下面使用Plotly backend探索一下数据集。

绘图方式与正常使用Pandas内置的绘图操作几乎相同,只是现在以丰富的Plotly显示可视化效果。

下面的代码绘制了数据集中两个要素之间的关系。

  1. fig = data[['Alcohol', 'Proline']].plot.scatter(y='Alcohol', x='Proline')  
  2. fig.show() 

如果将鼠标悬停在图表上,可以选择将图表下载为高质量的图像文件。

我们可以结合Pandas的groupby函数创建一个条形图,总结各类之间Hue的均值差异。

  1. data[['Hue','class']].groupby(['class']).mean().plot.bar() 

将class添加到我们刚才创建的散点图中。通过Plotly可以轻松地为每个类应用不同的颜色,以便直观地看到分类。

  1. fig = data[['Hue', 'Proline', 'class']].plot.scatter(x='Hue', y='Proline', color='class', title='Proline and Hue by wine class')  
  2. fig.show() 

3. Bokeh backend

Bokeh是另一个Python可视化包,也可提供丰富的交互式可视化效果。Bokeh还具有streaming API,可以为比如金融市场等流数据创建实时可视化。

pandas-Bokeh的GitHub链接如下:

https://github.com/PatrikHlobil/Pandas-Bokeh

老样子,用pip安装即可,pip install pandas-bokeh。

为了在Jupyterlab中显示Bokeh可视化效果,还需要安装两个新的扩展。

  1. jupyter labextension install @jupyter-widgets/jupyterlab-manager  
  2. jupyter labextension install @bokeh/jupyter_bokeh 

下面我们使用Bokeh backend重新创建刚刚plotly实现的的散点图。

  1. pd.options.plotting.backend = 'pandas_bokeh'  
  2. import pandas_bokeh  
  3. from bokeh.io import output_notebook  
  4. from bokeh.plotting import figure, show   
  5. output_notebook()  
  6. p1 = data.plot_bokeh.scatter(x='Hue',   
  7.                               y='Proline',   
  8.                               category='class',  
  9.                               title='Proline and Hue by wine class',  
  10.                               show_figure=False)  
  11. show(p1) 

关键语句就一行代码,非常快捷,交互式效果如下。

Bokeh还具有plot_grid函数,可以为多个图表创建类似于仪表板的布局,下面在网格布局中创建了四个图表。

  1. output_notebook()  
  2. p1 = data.plot_bokeh.scatter(x='Hue',   
  3.                               y='Proline',   
  4.                               category='class',  
  5.                               title='Proline and Hue by wine class',  
  6.                               show_figure=False)  
  7. p2 = data[['Hue','class']].groupby(['class']).mean().plot.bar(title='Mean Hue per Class')  
  8. df_hue = pd.DataFrame({  
  9.     'class_1': data[data['class'] == '1']['Hue'],  
  10.     'class_2': data[data['class'] == '2']['Hue'],  
  11.     'class_3': data[data['class'] == '3']['Hue']},  
  12.     columns=['class_1', 'class_2', 'class_3'])   
  13. p3 = df_hue.plot_bokeh.hist(title='Distribution per Class: Hue')  
  14. df_proline = pd.DataFrame({  
  15.     'class_1': data[data['class'] == '1']['Proline'],  
  16.     'class_2': data[data['class'] == '2']['Proline'],  
  17.     'class_3': data[data['class'] == '3']['Proline']},  
  18.     columns=['class_1', 'class_2', 'class_3'])   
  19. p4 = df_proline.plot_bokeh.hist(title='Distribution per Class: Proline')  
  20. pandas_bokeh.plot_grid([[p1, p2],   
  21.                         [p3, p4]], plot_width=450) 

可以看到,可视化的部分都是在pandas的dataframe基础上一行代码搞定,最后plot_grid完成布局。

4. 总结

在内置的Pandas绘图功能增加多个第三方可视化backend,大大增强了pandas用于数据可视化的功能,今后可能真的不需再去学习众多可视化操作了,使用pandas也可以一击入魂!

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